EBF1

EBF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3LYR, 3MQI
Ідентифікатори
Символи	EBF1, COE1, EBF, O/E-1, OLF1, early B-cell factor 1, early B cell factor 1, EBF transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 164343 MGI: 95275 HomoloGene: 7297 GeneCards: EBF1
Пов'язані генетичні захворювання
	рак молочної залози, ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з ДНК; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • protein dimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • C2H2 zinc finger domain binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• розвиток багатоклітинного організму; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • ДНК-матрична транскрипція; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1879
	13591
	ENSG00000164330
	ENSMUSG00000057098
	Q9UH73
	Q07802
NM_001290360; NM_024007; NM_182708; NM_001324101; NM_001324103;
	NM_001324106; NM_001324107; NM_001324108; NM_001324109; NM_001324111; NM_001364155; NM_001364156; NM_001364157; NM_001364158; NM_001364159
	NM_001290709; NM_001290710; NM_001290711; NM_007897
NP_001277289; NP_001311030; NP_001311032; NP_001311035; NP_001311036;
	NP_001311037; NP_001311038; NP_001311040; NP_076870; NP_874367; NP_001351084; NP_001351085; NP_001351086; NP_001351087; NP_001351088
NP_001277638; NP_001277639; NP_001277640; NP_031923; NP_001349498;
	NP_001349500; NP_001349503; NP_001349504; NP_001349505; NP_001349506; NP_001349507; NP_001349508
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EBF1 (англ. Early B-cell factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 591 амінокислот, а молекулярна маса — 64 464^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFGIQESIQR	SGSSMKEEPL	GSGMNAVRTW	MQGAGVLDAN	TAAQSGVGLA
RAHFEKQPPS	NLRKSNFFHF	VLALYDRQGQ	PVEIERTAFV	GFVEKEKEAN
SEKTNNGIHY	RLQLLYSNGI	RTEQDFYVRL	IDSMTKQAIV	YEGQDKNPEM
CRVLLTHEIM	CSRCCDKKSC	GNRNETPSDP	VIIDRFFLKF	FLKCNQNCLK
NAGNPRDMRR	FQVVVSTTVN	VDGHVLAVSD	NMFVHNNSKH	GRRARRLDPS
EGTPSYLEHA	TPCIKAISPS	EGWTTGGATV	IIIGDNFFDG	LQVIFGTMLV
WSELITPHAI	RVQTPPRHIP	GVVEVTLSYK	SKQFCKGTPG	RFIYTALNEP
TIDYGFQRLQ	KVIPRHPGDP	ERLPKEVILK	RAADLVEALY	GMPHNNQEII
LKRAADIAEA	LYSVPRNHNQ	LPALANTSVH	AGMMGVNSFS	GQLAVNVSEA
SQATNQGFTR	NSSSVSPHGY	VPSTTPQQTN	YNSVTTSMNG	YGSAAMSNLG
GSPTFLNGSA	ANSPYAIVPS	SPTMASSTSL	PSNCSSSSGI	FSFSPANMVS
AVKQKSAFAP	VVRPQTSPPP	TCTSTNGNSL	QAISGMIVPP	M

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111
Gisler R., Jacobsen S.E., Sigvardsson M. (2000). Cloning of human early B-cell factor and identification of target genes suggest a conserved role in B-cell development in man and mouse. Blood. 96: 1457—1464. PMID 10942392

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з EBF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3126 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9UH73 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2018. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з EBF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3126 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q9UH73 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2018. Процитовано 31 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]